Lembaga Penjaminan Mutu (LPM) STAIMTUL secara resmi dibentuk pada tahun 2018 yang pada saat itu cakupan tugasnya masih spesifik mengurusi akreditasi program studi (Prodi). Sejalan dengan peraturan pemerintah, terkait dengan kegiatan penjaminan mutu proses pembelajaran dan meliputi perencanaan sasaran mutu, monitoring dan evaluasi pelaksanaan rencana mutu, serta pemeliharaan dan peningkatan mutu secara berkesinambungan. Program peningkatan mutu antara lain berupa pelatihan-pelatihan dosen agar memiliki kompetensi pendidik dengan kemampuan desain pembelajaran yang baik.